La Dirección de Gabinetes Técnicos Interdisciplinarios de Educación es una dependencia del Ministerio de Educación de la provincia que funciona en el edificio del Centro Cívico.

La Coordinación General de la Unidad Ejecutora de Programas de Inversión Educativa es un organismo dependiente del Ministerio de Educación de San Juan.

En el Centro Cívico de San Juan funciona la Coordinación de Programas de Planes Nacionales de Becas.

La Dirección de Área Pedagógica de la Dirección de Programas de Inversión Educativa funciona en el edificio del Centro Cívico de San Juan.

En el ámbito del Ministerio de Educación funciona la Dirección de Infraestructura de la Unidad Ejecutora de Programas de Inversión.

La Secretaría de Coordinación Administrativa Financiera es una de las dependecias del Ministerio de Educación de la provincia.

La Dirección de Área Administrativa es una dependencia de la Secretaría de Coordinación Administrativo Financiera del Ministerio de Educación.

En el ámbito del Ministerio de Educación de la provincia funciona el PROMSE: Programa de Mejoramiento del Sistema Educativo.

El Plan Nacional de Becas Estudiantiles cuenta en la provincia con un referente jurisdiccional.

La Dirección de Regímenes Promocionales es una dependencia del Ministerio de Producción y Desarrollo Económico. Funciona en el Edificio 9 de Julio.